MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 plasmid pGEOTH02

Total Repeats: 302

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015661	GTTA	2	8	91	98	25 %	50 %	25 %	0 %	336237225
2	NC_015661	AAC	2	6	109	114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336237225
3	NC_015661	TGA	2	6	119	124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237225
4	NC_015661	GAA	2	6	199	204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237225
5	NC_015661	TAT	2	6	219	224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336237225
6	NC_015661	T	6	6	244	249	0 %	100 %	0 %	0 %	336237225
7	NC_015661	GCT	2	6	252	257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237225
8	NC_015661	A	6	6	288	293	100 %	0 %	0 %	0 %	336237225
9	NC_015661	GAGG	2	8	312	319	25 %	0 %	75 %	0 %	336237225
10	NC_015661	T	7	7	320	326	0 %	100 %	0 %	0 %	336237225
11	NC_015661	GGC	2	6	330	335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336237225
12	NC_015661	AC	3	6	359	364	50 %	0 %	0 %	50 %	336237225
13	NC_015661	TTA	2	6	403	408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336237225
14	NC_015661	ACA	2	6	412	417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336237225
15	NC_015661	ATG	2	6	425	430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237225
16	NC_015661	AGA	2	6	469	474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237225
17	NC_015661	T	8	8	484	491	0 %	100 %	0 %	0 %	336237225
18	NC_015661	CAA	2	6	515	520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336237225
19	NC_015661	ACA	2	6	551	556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336237225
20	NC_015661	ATT	2	6	567	572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336237225
21	NC_015661	GAA	2	6	586	591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237225
22	NC_015661	TAAA	2	8	671	678	75 %	25 %	0 %	0 %	336237225
23	NC_015661	AG	3	6	767	772	50 %	0 %	50 %	0 %	336237225
24	NC_015661	CTAT	2	8	781	788	25 %	50 %	0 %	25 %	336237225
25	NC_015661	TAAG	2	8	845	852	50 %	25 %	25 %	0 %	336237225
26	NC_015661	TGC	2	6	867	872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237225
27	NC_015661	TTC	2	6	887	892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237225
28	NC_015661	AGG	2	6	978	983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336237225
29	NC_015661	A	6	6	985	990	100 %	0 %	0 %	0 %	336237225
30	NC_015661	A	6	6	1039	1044	100 %	0 %	0 %	0 %	336237225
31	NC_015661	GAA	2	6	1087	1092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237225
32	NC_015661	GAA	2	6	1097	1102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237225
33	NC_015661	A	7	7	1118	1124	100 %	0 %	0 %	0 %	336237225
34	NC_015661	AGA	2	6	1209	1214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237225
35	NC_015661	ATA	2	6	1236	1241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336237225
36	NC_015661	TTG	2	6	1292	1297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336237226
37	NC_015661	CAAG	2	8	1302	1309	50 %	0 %	25 %	25 %	336237226
38	NC_015661	ATC	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237226
39	NC_015661	CTT	2	6	1332	1337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237226
40	NC_015661	TCT	2	6	1385	1390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237226
41	NC_015661	TCA	2	6	1436	1441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237226
42	NC_015661	TCCTCT	2	12	1523	1534	0 %	50 %	0 %	50 %	336237226
43	NC_015661	CAT	2	6	1549	1554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237226
44	NC_015661	AAT	2	6	1562	1567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336237226
45	NC_015661	T	6	6	2648	2653	0 %	100 %	0 %	0 %	336237227
46	NC_015661	TTG	2	6	2706	2711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336237227
47	NC_015661	TTC	2	6	2720	2725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237227
48	NC_015661	AAT	2	6	2747	2752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336237227
49	NC_015661	TGC	2	6	2771	2776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237227
50	NC_015661	AT	3	6	2783	2788	50 %	50 %	0 %	0 %	336237227
51	NC_015661	TCG	2	6	2789	2794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237227
52	NC_015661	ACG	2	6	2815	2820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336237227
53	NC_015661	T	6	6	2821	2826	0 %	100 %	0 %	0 %	336237227
54	NC_015661	ATC	2	6	2863	2868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237227
55	NC_015661	TTC	2	6	2893	2898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237227
56	NC_015661	GAT	2	6	2920	2925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237227
57	NC_015661	TCG	2	6	3020	3025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237227
58	NC_015661	GCTT	2	8	3113	3120	0 %	50 %	25 %	25 %	336237227
59	NC_015661	TA	3	6	3342	3347	50 %	50 %	0 %	0 %	336237227
60	NC_015661	AC	3	6	3435	3440	50 %	0 %	0 %	50 %	336237227
61	NC_015661	AT	3	6	3491	3496	50 %	50 %	0 %	0 %	336237227
62	NC_015661	CCG	2	6	3542	3547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336237227
63	NC_015661	GCT	2	6	3627	3632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237227
64	NC_015661	TCT	2	6	3638	3643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237227
65	NC_015661	CAAT	2	8	3677	3684	50 %	25 %	0 %	25 %	336237227
66	NC_015661	TGG	2	6	3720	3725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336237227
67	NC_015661	T	6	6	3778	3783	0 %	100 %	0 %	0 %	336237227
68	NC_015661	T	6	6	3832	3837	0 %	100 %	0 %	0 %	336237227
69	NC_015661	ACAA	2	8	3856	3863	75 %	0 %	0 %	25 %	336237227
70	NC_015661	TTC	2	6	3872	3877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237227
71	NC_015661	TTC	2	6	3904	3909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237227
72	NC_015661	CAA	2	6	3931	3936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336237227
73	NC_015661	A	6	6	3935	3940	100 %	0 %	0 %	0 %	336237227
74	NC_015661	TCCA	2	8	4467	4474	25 %	25 %	0 %	50 %	336237228
75	NC_015661	TCG	2	6	4553	4558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237228
76	NC_015661	ATC	2	6	4569	4574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237228
77	NC_015661	CAT	2	6	4609	4614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237229
78	NC_015661	TCC	2	6	4615	4620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336237229
79	NC_015661	AG	3	6	4644	4649	50 %	0 %	50 %	0 %	336237229
80	NC_015661	AAG	2	6	4746	4751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237229
81	NC_015661	CCA	2	6	4895	4900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336237229
82	NC_015661	CAT	2	6	4907	4912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237229
83	NC_015661	GTT	2	6	5194	5199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336237230
84	NC_015661	AGC	2	6	5236	5241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336237230
85	NC_015661	AT	3	6	5244	5249	50 %	50 %	0 %	0 %	336237230
86	NC_015661	CAA	2	6	5272	5277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336237230
87	NC_015661	AT	3	6	5353	5358	50 %	50 %	0 %	0 %	336237230
88	NC_015661	TGA	2	6	5362	5367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237230
89	NC_015661	A	8	8	5379	5386	100 %	0 %	0 %	0 %	336237230
90	NC_015661	T	7	7	5981	5987	0 %	100 %	0 %	0 %	336237231
91	NC_015661	CTTTT	2	10	5990	5999	0 %	80 %	0 %	20 %	336237231
92	NC_015661	T	6	6	5996	6001	0 %	100 %	0 %	0 %	336237231
93	NC_015661	T	7	7	6045	6051	0 %	100 %	0 %	0 %	336237231
94	NC_015661	TACT	2	8	6099	6106	25 %	50 %	0 %	25 %	336237231
95	NC_015661	GAAT	2	8	6148	6155	50 %	25 %	25 %	0 %	336237231
96	NC_015661	AAT	2	6	6174	6179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336237231
97	NC_015661	TAT	2	6	6183	6188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336237231
98	NC_015661	CTTT	2	8	6240	6247	0 %	75 %	0 %	25 %	336237231
99	NC_015661	T	6	6	6245	6250	0 %	100 %	0 %	0 %	336237231
100	NC_015661	TAC	2	6	6268	6273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237231
101	NC_015661	TGA	3	9	6286	6294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237231
102	NC_015661	TAC	2	6	6313	6318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237231
103	NC_015661	TGCTC	2	10	6341	6350	0 %	40 %	20 %	40 %	336237231
104	NC_015661	CA	3	6	6369	6374	50 %	0 %	0 %	50 %	336237231
105	NC_015661	CCG	2	6	6383	6388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336237231
106	NC_015661	T	8	8	6403	6410	0 %	100 %	0 %	0 %	336237231
107	NC_015661	T	7	7	6450	6456	0 %	100 %	0 %	0 %	336237231
108	NC_015661	T	7	7	6480	6486	0 %	100 %	0 %	0 %	336237231
109	NC_015661	T	7	7	6493	6499	0 %	100 %	0 %	0 %	336237231
110	NC_015661	TTTA	2	8	6625	6632	25 %	75 %	0 %	0 %	336237232
111	NC_015661	TA	3	6	6677	6682	50 %	50 %	0 %	0 %	336237232
112	NC_015661	CGT	2	6	6687	6692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336237232
113	NC_015661	ACTC	2	8	6884	6891	25 %	25 %	0 %	50 %	336237232
114	NC_015661	TTTC	2	8	6902	6909	0 %	75 %	0 %	25 %	336237232
115	NC_015661	TCAT	2	8	6949	6956	25 %	50 %	0 %	25 %	336237232
116	NC_015661	TCAT	2	8	7024	7031	25 %	50 %	0 %	25 %	336237232
117	NC_015661	TAAC	2	8	7082	7089	50 %	25 %	0 %	25 %	336237232
118	NC_015661	TTG	2	6	7176	7181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336237232
119	NC_015661	AAG	2	6	7318	7323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237232
120	NC_015661	GTT	2	6	7355	7360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336237232
121	NC_015661	CTT	2	6	7448	7453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237232
122	NC_015661	GAT	2	6	7760	7765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237233
123	NC_015661	GT	3	6	7802	7807	0 %	50 %	50 %	0 %	336237233
124	NC_015661	ACG	2	6	7917	7922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336237233
125	NC_015661	AGT	2	6	7958	7963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237233
126	NC_015661	CAG	2	6	8009	8014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336237233
127	NC_015661	A	6	6	8042	8047	100 %	0 %	0 %	0 %	336237233
128	NC_015661	GAT	2	6	8069	8074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237233
129	NC_015661	CAAA	2	8	8101	8108	75 %	0 %	0 %	25 %	336237233
130	NC_015661	ATG	2	6	8129	8134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237233
131	NC_015661	CAA	2	6	8144	8149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336237233
132	NC_015661	AGA	2	6	8262	8267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237233
133	NC_015661	A	6	6	8267	8272	100 %	0 %	0 %	0 %	336237233
134	NC_015661	ATAG	2	8	8299	8306	50 %	25 %	25 %	0 %	336237233
135	NC_015661	T	6	6	9511	9516	0 %	100 %	0 %	0 %	336237234
136	NC_015661	TCC	2	6	9551	9556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336237234
137	NC_015661	CTT	2	6	9589	9594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237234
138	NC_015661	GTA	2	6	9601	9606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336237234
139	NC_015661	CCG	2	6	9614	9619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336237234
140	NC_015661	ACC	2	6	9720	9725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336237234
141	NC_015661	TC	4	8	9769	9776	0 %	50 %	0 %	50 %	336237235
142	NC_015661	ATTTT	2	10	9803	9812	20 %	80 %	0 %	0 %	336237235
143	NC_015661	TCAA	2	8	9832	9839	50 %	25 %	0 %	25 %	336237235
144	NC_015661	CCT	2	6	9897	9902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336237236
145	NC_015661	TTC	2	6	9913	9918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237236
146	NC_015661	CAT	2	6	9967	9972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237236
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148	NC_015661	CTT	2	6	10002	10007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237236
149	NC_015661	CTT	2	6	10009	10014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237236
150	NC_015661	TGT	2	6	10026	10031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336237236
151	NC_015661	ATT	2	6	10395	10400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336237237
152	NC_015661	ACT	2	6	10432	10437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237237
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157	NC_015661	TTG	2	6	10613	10618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336237237
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163	NC_015661	AGA	2	6	10878	10883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336237237
164	NC_015661	AAT	2	6	10939	10944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336237237
165	NC_015661	AAT	2	6	10948	10953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336237237
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170	NC_015661	TTGG	2	8	11991	11998	0 %	50 %	50 %	0 %	336237238
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253	NC_015661	AATC	2	8	17312	17319	50 %	25 %	0 %	25 %	336237244
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259	NC_015661	CG	3	6	17484	17489	0 %	0 %	50 %	50 %	336237244
260	NC_015661	CTT	2	6	17491	17496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237244
261	NC_015661	GCA	2	6	17535	17540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336237244
262	NC_015661	GTTT	2	8	17592	17599	0 %	75 %	25 %	0 %	336237244
263	NC_015661	AGAA	2	8	17670	17677	75 %	0 %	25 %	0 %	336237244
264	NC_015661	TCA	2	6	17766	17771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237244
265	NC_015661	TCT	2	6	17781	17786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237244
266	NC_015661	TCA	2	6	17848	17853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237244
267	NC_015661	T	6	6	17856	17861	0 %	100 %	0 %	0 %	336237244
268	NC_015661	AAT	2	6	17897	17902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336237244
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270	NC_015661	CTT	2	6	18070	18075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336237244
271	NC_015661	AGCT	2	8	18101	18108	25 %	25 %	25 %	25 %	336237244
272	NC_015661	TGAT	2	8	18117	18124	25 %	50 %	25 %	0 %	336237244
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276	NC_015661	TCA	2	6	18348	18353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336237244
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280	NC_015661	TGTA	2	8	18517	18524	25 %	50 %	25 %	0 %	336237244
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283	NC_015661	GTT	2	6	18622	18627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336237244
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298	NC_015661	ACC	2	6	19213	19218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336237244
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300	NC_015661	T	6	6	19439	19444	0 %	100 %	0 %	0 %	336237245
301	NC_015661	GGT	2	6	19449	19454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336237245
302	NC_015661	CCT	2	6	19534	19539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336237245

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.